Den första stora vävnadsanalysen av människans proteiner
Bildtext
I november 2014 släpptes den fullständiga vävnadskartan av människokroppen på proteinatlasen. Nu publiceras den första riktigt stora analysen baserad på kartläggningen i tidskriften Science. Den ger många viktiga insikter för pågående forskning och läkemedelsutveckling.
Analysen har letts av professor Mathias Uhlén vid KTH, i samarbete med Uppsala universitet, Karolinska Institutet, Chalmers, Lunds Universitet och Stockholms Universitet. Professor Fredrik Pontén, Uppsala universitet är nöjd med att man nått målet tillsammans och nu har så pass täckande data att det går att göra globala analyser över hur människans proteiner uttrycks i kroppen.
- Det har varit en fantasitskt lagarbete där forskare med olika bakgrund och kunnande bidragit till att projektet hela tiden utvecklats åt rätt håll. Extra roligt är att patologin kommit så i fokus, att vi kunnat samverka kring och utnyttja den kliniska patologin och de vävnadsresurser som finns, säger han.
Forskarna har gått igenom vilka olika proteiner som finns i människokroppens olika delar, liksom vilka proteiner som enbart finns i njurar, lever, hjärna och så vidare. I proteinatlasen går det lätt att söka på ett visst protein och se vart det förekommer och lika bra att söka på ett organ, eller en viss sjukdom, och se vilka proteiner som kan knytas till dem. Analysen visar vidare hur många proteiner som återfinns i cellmembranet respektive i blodomloppet. Cirka 3 000 av människans proteiner bedöms transporteras ut ur cellerna, medan ytterligare 5 000 är membranbundna. Detta är viktig kunskap för läkemedelsindustrin. 70 procent av dagens läkemedlen riktar in sig mot proteiner som antingen finns utanför cellerna eller på ytan.
Inom ramen för analysarbetet gjordes också en studie av samtliga läkemedlen som finns på marknaden genom de 618 proteiner som dessa läkemedel är riktade mot. 30 procent av dessa proteiner återfinns i alla celler i kroppen.
- Detta är intressant information för läkemedelsforskning och kan förklara en del av de problem och biverkningar som vissa läkemedel dras med, säger Mathias Uhlén.
Den fullständiga vävnadskartan av människroppensläpptes på proteinatlasen den 6 november 2014 och kan nås via projektet webbplats: http://www.proteinatlas.org
Artikeln i Science bär titeln "Tissue-based map of the human proteome" och kan läsas på webben: http://dx.doi.org/10.1126/science.1260149
Anneli Waara