Protein engineering
Kursplan, Avancerad nivå, 1BG301
- Kod
- 1BG301
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi A1F, Kemi A1F, Teknik A1F, Tillämpad bioteknik A1F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 25 maj 2012
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
150 hp inklusive någon av kurserna Molekylär cellbiologi, Genomfunktion, Molekylärmedicinsk infektionsbiologi eller Genombiologi. Alternativt 30 hp inom masterprogrammen Tillämpad bioteknik, Molekylär bioteknik eller Kemi, inriktning biokemi.
Mål
Studenterna får under kursen möta ett aktuellt molekylärbiologiskt och genteknologiskt problem. Målet är att ge dem fördjupade kunskaper och färdigheter som gör det möjligt att självständigt finna lösningar och i praktiken genomföra dessa lösningar. Efter godkänd kurs ska studenten kunna
- analysera proteiners struktur och uppbyggnad med datorbaserade metoder
- redogöra för proteiners uppbyggnad och klassificering
- analysera och jämföra proteiners aminosyresekvens och struktur samt relatera denna information till proteiners funktion
- redogöra för enskilda aminosyrors egenskaper och inverkan på proteiners löslighetsegenskaper, struktur och funktion
- redogöra för faktorer av betydelse för proteinveckningsprocesser och stabilitet
- redogöra för hur proteiner kan användas för olika industriella och akademiska ändamål, såsom strukturbestämning, organisk syntes och läkemedelsdesign
- analysera proteiners renhet och stabilitet och redogöra för hur de kan förvaras på bästa sätt
- redovisa hur man med biotekniska metoder kan konstruera plasmider för expression av naturliga och modifierade gener
- planera mutagenesexperiment för att testa proteinstabilitet och/eller funktion
- konstruera primers för att introducera mutationer med hjälp av PCR
- genomföra ett PCR-baserat mutagenesexperiment
- med biokemiska metoder isolera proteiner
- planera och genomföra aktivitetsmätningar av isolerat protein, samt karaktärisera renhet och stabilitet av proteinet
- föra laboratoriedagbok enligt GLP
- utforma en enkel forskningsplan för en bioteknologisk uppfinning
Innehåll
Föreläsningar och datorbaserade övningar om bioteknologiska metoder och proteiners uppbyggnad, struktur och funktion. Föreläsningar om industriella och andra tillämpningar. Projektbaserade bioteknologiska experiment.
Produktion av modifierade produkter.
Studenten ska även presentera bioteknologiska problemlösningar och resultat, samt genomföra dokumentation av den laborativa delen som motsvarar de krav som de kommer att möta i ett kommande yrkesliv.
Undervisning
Undervisningen ges i form av föreläsningar, gästföreläsningar, seminarier, gruppövningar och laborationer. Deltagande i seminarier, laborationer och därtill hörande lektionsundervisning, gruppövningar, duggor och datorövningar är obligatorisk.
Examination
Teoridelkurs (7 hp):
Skriftlig examination som omfattar bioteknologiska metoder, proteinfysikaliska metoder samt proteiners uppbyggnad och klassificering.
Praktisk del:
Studenten ska redovisa en korrekt utförd (enligt GLP) laboratoriedagbok och redovisa experimentella resultat (5 hp) samt redovisa en enkel forskningsplan (3 hp).
Litteraturlista
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2024
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2023
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2020
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2019
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2016
- Litteraturlista giltig från och med vårterminen 2013
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2012, version 3
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2012, version 2
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2012, version 1
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2011
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2007