Bioinformatiska analyser IIa
Kursplan, Avancerad nivå, 1BG337
- Kod
- 1BG337
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi A1N, Teknik A1N
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 6 november 2007
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
Bioinformatiska analyser I.
Mål
Kursen fokuserar på evolutionära analyser och analyser av biologisk mångfald. Efter kursen skall studenten kunna
Innehåll
Kursen behandlar främst bioinformatik med inriktning på evolutionära analyser och innehåller följande moment och aspekter:
Modeller för sekvensevolution och statistiska sekvensjämförelser. Fylogenianalys; träd och nätverk, parsimoni, distansmetoder, trolighetsbaserade metoder (maximum likelihood och Bayesianska analyser). Multivariata metoder för datareduktion och visualisering (t.ex. PCA och MDS). GIS. Databaser för biodiversitet.
Delkurser: Teori 2 hp; datorövningar 2 hp; projekt 1 hp
Undervisning
Undervisningen ges i form av datorbaserad nätundervisning, föreläsningar, datorövningar och projektuppgift.
Examination
För godkänd kurs krävs att samtliga datorövningar motsvarande 2 hp och projektuppgift motsvarande 1 hp har redovisats skriftligen och är godkända. Teoridelen examineras med ett skriftligt prov motsvarande 2 hp.