Behörighetskrav

120 hp samt Genombioinformatik och Molekylär evolution och fylogenianalys

Mål

Kursen syftar till att ge kunskap om teori och analysmetoder inom populationsgenetik och kvantitativ genetik.

Efter godkänd kurs skall studenten kunna:

• lösa biologiska problem med hjälp av populationsgenetik och kvantitativ genetik.
• förklara principerna för populationsgenetiken och den kvantitativa genetiken.
• identifiera relevanta populationsgenetiska problemställningar och formulera strategier för att lösa problemen.
• utnyttja tidigare kvantitativa kunskaper (matematik, statistik, programmering) för att lösa genetiska problem.

Innehåll

Kursen börjar med en introduktion där baskunskaper repeteras (nedärvning och mendelsk genetik), därefter följer kursens tre huvudblock:

• Populationsgenetikens principer: allelfrekvenser, allelefrekvensspektrum, kopplingsojämvikt, genetisk diversitet och mått på diversitet, Wright-Fisher-modellen, koalescensteori, inavel, populationsstruktur och selektion.
• Populationsgenetisk analys: koalescensteori och simuleringar, skattning av parametrar (mutationstakt, rekombinationstakt) och neutralitetstest. Exempel på komplexa modeller.
• Kvantitativ genetik: basala modellen för kvantitativ genetik, analys av kvantitativa egenskaper, QTL och associationskartering, heritabilitet.

Undervisning

Undervisningen ges i form av föreläsningar, seminarier och övningar (räkneövningar, analysuppgifter och datorövningar).

Examination

Teori 2 hp; seminarier och övningar 3 hp. För godkänd kurs krävs deltagande i minst 80% av seminarierna och att samtliga analysuppgifter har redovisats skriftligen och är godkända. Teoridelen examineras genom ett skriftligt prov.