Makromolekylers struktur och funktion
Kursplan, Avancerad nivå, 1BG349
- Kod
- 1BG349
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi A1N, Tillämpad bioteknik A1N
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 4 juni 2015
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
150 hp avklarade kurser inklusive alt. 1) 60 hp biologi och 30 hp kemi; alt. 2) 90 hp biologi; alt. 3) antagen till masterprogrammet i kemi, inriktning biokemi.
Mål
Det övergripande målet med denna kurs är att ge studenten avancerade kunskaper om relationen mellan makromolekylers struktur och funktion. Efter godkänd kurs ska studenten kunna
- redogöra för grunderna för biologiska makromolekylers uppbyggnad och egenskaper
- förklara strukturella mekanismer för hur viktiga biologiska processer sker och kontrolleras: t.ex. katalys, cellsignalering, transkription, och translation
- förklara uppbyggnad av komplex som ribosomer och proteasomer och av aggregat som filament och tubuli
- redogöra för principerna för de viktigaste metoderna för strukturanalys: röntgenkristallografi, NMR och elektronmikroskopi och analysera kvaliteten i de modeller som metoderna leder till
- analysera strukturella detaljer i makromolekyler med hjälp av molekylgrafikprogram
- använda databaser med information om makromolekylers struktur och funktion
- använda, analysera och kritiskt granska resultat av metoder för förutsägelse av sekundär- och tertiärstruktur av makromolekyler
- förklara grundläggande koncept och kritiskt granska relativa styrkor och svagheter hos beräkningsbiologiska metoder
Innehåll
Grundläggande strukturbiologi och strukturell bioinformatik
Metoder för experimentell strukturbestämning av makromolekyler och komplex. Grundläggande makromolekylär struktur, proteiner, DNA och RNA . Biologiska sekvens- och strukturdatabaser. Samband mellan sekvens, struktur och funktion. Förutsägelse av sekundär- och tertiärstruktur baserat på sekvensdata. Strukturanalys och klassificering av proteiner i strukturfamiljer.
Cellens strukturbiologi
Makromolekylär struktur och funktion i bland annat transkription, translation och veckning. Veckningsprocessen och strukturell bakgrund till makromolekylers dynamik.
Enzymers struktur och funktion
Bindningsspecificitet, katalys och kooperativitet i enzymer och receptorer. Introduktion till datormodellering av ligandbindning, proteinveckning och enzymkatalys.
Undervisning
Undervisningen sker i form av föreläsningar, datorövningar, laborationer, seminarier och projekt. Deltagande i datorövningar, laborationer, seminarier och projekt är obligatoriskt.
Examination
Delkurser: Teori 7 hp; Seminarier, datorövningar och laborationer 3 hp; Projekt 3,5 hp; Skriftlig rapport i beräkningsbiologi 1,5 hp
Teorin examineras genom skriftliga prov. Seminarier, datorövningar och laborationer fordrar aktivt deltagande. Projektet examineras genom skriftlig och muntlig redovisning.
Övriga föreskrifter
Kan ej tillgodoräknas i examen samtidigt med 1BG351 Biomolekylers struktur och funktion 10 hp.
Litteraturlista
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2023, version 2
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2023, version 1
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2022
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2020
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2019
- Litteraturlista giltig från och med vårterminen 2016
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2015
- Litteraturlista giltig från och med vårterminen 2013
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2012
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2011
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2010
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2008