Molekylär modellering och simulering
Kursplan, Avancerad nivå, 1KB359
- Kod
- 1KB359
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Fysik A1F, Kemi A1F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 30 augusti 2018
- Ansvarig institution
- Institutionen för kemi - Ångström
Behörighetskrav
120 hp med 60 hp kemi eller fysik. Kemisk bindning med beräkningskemi, 10 hp rekommenderas. Engelska 6. (Med en svensk kandidatexamen uppfylls kravet på engelska.)
Mål
Efter godkänd kurs skall studenten kunna:
- värdera och analysera användbarhet och begränsningar i både modeller och simuleringsmetoder
- beskriva olika beräkningsmetoder som används för att beräkna fri energi och kemisk potential och bedöma vilken metod som bör användas för olika typer av frågeställningar
- analysera kemiskt relevanta frågeställningar med avseende på användningen av olika simuleringsverktyg såsom periodiska randvillkor, parallellberäkningar, klusterförflyttningar och slumptalsgenerering
- tillämpa olika simuleringsmetoder för att modellera dynamik och struktur hos molekyler, vätskor och fasta material samt presentera resultatet i en rapport som motsvarar kursens nivå
- söka, sammanställa och presentera information som utgår från en frågeställning relaterad till kursinnehållet
Innehåll
Molekyldynamik, Monte Carlosimuleringar. Brownsk dynamik. Lagrange- och Hamiltonfunktionen. Utökade Lagrangemetoder. Simulering i olika ensembler. Kraftfält för molekyler, vätskor och fasta material. Flerkropps- och polarisationsmodeller. Tillståndssummor och fri energi. Fasjämvikt och fasövergångar. Simulering i bulk, av ytor, polymerer och kolloider.
Undervisning
Föreläsningar, seminarier, projekt och laborationer
Examination
Inlämningsuppgifter samt skriftligt och/eller muntligt prov vid kursens slut 3 hp. Laborationer och projekt 2 hp. Slutbetyget motsvarar en sammanvägning av resultatet av den teoretiska delen och laborationerna.
Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t.ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.
Övriga föreskrifter
Kursen kan inte tillgodoräknas i examen tillsammans med kursen 1KB353.