Katja Petzolds forskargrupp

Vår forskargrupp är intresserad av att förstå hur RNA förändrar sina strukturer för att kunna utföra sina funktioner.

Strukturell biofysik hos RNA

Fram tills nyligen kunde endast ögonblicksbilder av molekyler observeras, vilket dolde deras funktionssätt. Vi använder kärnmagnetisk resonans (NMR) och andra biofysiska tekniker (t.ex RNA probing/SHAPE) för att undersöka de molekylära mekanismerna bakom RNA-funktion. När funktionen hos dessa molekylära maskiner blir uppenbar, öppnar det också upp för en mängd unika nya läkemedelsmål. Laboratoriet utvecklar metoder inom NMR och RNA-biokemi för att hantera dessa frågor. Nuvarande projekt inkluderar virala, bakteriella och eukaryota reglerande RNA, t.ex. mikroRNA, ribosomala RNA eller RNA från hepatit B-virus (HBV).

Gruppmedlemmar

Forskningsledare: Katja Petzold

Gruppmedlemmar: Henry Annecke, Katja Bekcic, Rubin Dasgupta, Vivek Junghare, Magdalena Riad, Saskia Rughöft, Joanna Sajkowska-Kozielewicz, Christian Steinmetzger

Publikationer

Elucidating microRNA-34a organisation within human Argonaute-2 by dynamic nuclear polarisation-enhanced magic angle spinning NMR

Dasgupta, Rubin; Becker, Walter; Petzold, Katja

Ingår i Nucleic Acids Research, s. 11995-12004, 2024
- DOI för Elucidating microRNA-34a organisation within human Argonaute-2 by dynamic nuclear polarisation-enhanced magic angle spinning NMR
- Ladda ner fulltext (pdf) av Elucidating microRNA-34a organisation within human Argonaute-2 by dynamic nuclear polarisation-enhanced magic angle spinning NMR
Investigating Interaction Dynamics of an Enantioselective Peptide‐Catalyzed Acylation Reaction

Brauser, Matthias; Petzold, Katja; Thiele, Christina M.

Ingår i Angewandte Chemie International Edition, 2024
- DOI för Investigating Interaction Dynamics of an Enantioselective Peptide‐Catalyzed Acylation Reaction
Efficient 3′-pairing renders microRNA targeting less sensitive to mRNA seed accessibility

Kosek, David M; Banijamali, Elnaz; Becker, Walter; Petzold, Katja et al.

Ingår i Nucleic Acids Research, s. 11162-11177, 2023
- DOI för Efficient 3′-pairing renders microRNA targeting less sensitive to mRNA seed accessibility
- Ladda ner fulltext (pdf) av Efficient 3′-pairing renders microRNA targeting less sensitive to mRNA seed accessibility
Mass Spectrometry of RNA-Binding Proteins during Liquid-Liquid Phase Separation Reveals Distinct Assembly Mechanisms and Droplet Architectures

Sahin, Cagla; Motso, Aikaterini; Gu, Xinyu; Feyrer, Hannes et al.

Ingår i Journal of the American Chemical Society, s. 10659-10668, 2023
- DOI för Mass Spectrometry of RNA-Binding Proteins during Liquid-Liquid Phase Separation Reveals Distinct Assembly Mechanisms and Droplet Architectures
- Ladda ner fulltext (pdf) av Mass Spectrometry of RNA-Binding Proteins during Liquid-Liquid Phase Separation Reveals Distinct Assembly Mechanisms and Droplet Architectures
NanoBiT‐ and NanoBiT/BRET‐based assays allow the analysis of binding kinetics of Wnt‐3a to endogenous Frizzled 7 in a colorectal cancer model

Grätz, Lukas; Sajkowska‐Kozielewicz, Joanna J.; Wesslowski, Janine; Kinsolving, Julia et al.

Ingår i British Journal of Pharmacology, 2023
- DOI för NanoBiT‐ and NanoBiT/BRET‐based assays allow the analysis of binding kinetics of Wnt‐3a to endogenous Frizzled 7 in a colorectal cancer model
Fler publikationer