Katja Petzolds forskargrupp

Vår forskargrupp är intresserad av att förstå hur RNA förändrar sina strukturer för att kunna utföra sina funktioner.

Strukturell biofysik hos RNA

Fram tills nyligen kunde endast ögonblicksbilder av molekyler observeras, vilket dolde deras funktionssätt. Vi använder kärnmagnetisk resonans (NMR) och andra biofysiska tekniker (t.ex RNA probing/SHAPE) för att undersöka de molekylära mekanismerna bakom RNA-funktion. När funktionen hos dessa molekylära maskiner blir uppenbar, öppnar det också upp för en mängd unika nya läkemedelsmål. Laboratoriet utvecklar metoder inom NMR och RNA-biokemi för att hantera dessa frågor. Nuvarande projekt inkluderar virala, bakteriella och eukaryota reglerande RNA, t.ex. mikroRNA, ribosomala RNA eller RNA från hepatit B-virus (HBV).

SciLifeLab

Livets kemiska mekanismer

Gruppmedlemmar

Forskningsledare: Katja Petzold

Gruppmedlemmar: Henry Annecke, Harish Balasubramanian, Katja Bekcic, Uno Bolin Hartl, Rubin Dasgupta, Vivek Junghare, Magdalena Riad, Saskia Rughöft, Joanna Sajkowska-Kozielewicz, Christian Steinmetzger

Publikationer

Mapping effective microRNA pairing beyond the seed using abasic modifications

Kosek, David; Petzold, Katja; Andersson, Emma R.

Ingår i Nucleic Acids Research, 2025
- DOI för Mapping effective microRNA pairing beyond the seed using abasic modifications
- Ladda ner fulltext (pdf) av Mapping effective microRNA pairing beyond the seed using abasic modifications
Elucidating microRNA-34a organisation within human Argonaute-2 by dynamic nuclear polarisation-enhanced magic angle spinning NMR

Dasgupta, Rubin; Becker, Walter; Petzold, Katja

Ingår i Nucleic Acids Research, s. 11995-12004, 2024
- DOI för Elucidating microRNA-34a organisation within human Argonaute-2 by dynamic nuclear polarisation-enhanced magic angle spinning NMR
- Ladda ner fulltext (pdf) av Elucidating microRNA-34a organisation within human Argonaute-2 by dynamic nuclear polarisation-enhanced magic angle spinning NMR
Investigating Interaction Dynamics of an Enantioselective Peptide‐Catalyzed Acylation Reaction

Brauser, Matthias; Petzold, Katja; Thiele, Christina M.

Ingår i Angewandte Chemie International Edition, 2024
- DOI för Investigating Interaction Dynamics of an Enantioselective Peptide‐Catalyzed Acylation Reaction
- Ladda ner fulltext (pdf) av Investigating Interaction Dynamics of an Enantioselective Peptide‐Catalyzed Acylation Reaction
Optimising in-cell NMR acquisition for nucleic acids

Annecke, Henry T. P.; Eidelpes, Reiner; Feyrer, Hannes; Ilgen, Julian et al.

Ingår i Journal of Biomolecular NMR, s. 249-264, 2024
- DOI för Optimising in-cell NMR acquisition for nucleic acids
- Ladda ner fulltext (pdf) av Optimising in-cell NMR acquisition for nucleic acids
Efficient 3′-pairing renders microRNA targeting less sensitive to mRNA seed accessibility

Kosek, David M; Banijamali, Elnaz; Becker, Walter; Petzold, Katja et al.

Ingår i Nucleic Acids Research, s. 11162-11177, 2023
- DOI för Efficient 3′-pairing renders microRNA targeting less sensitive to mRNA seed accessibility
- Ladda ner fulltext (pdf) av Efficient 3′-pairing renders microRNA targeting less sensitive to mRNA seed accessibility
Fler publikationer