Joakim Näsvalls forskargrupp
Vår forskning fokuserar på en väldigt grundläggande fråga i evolutionsbiologi; hur nya gener bildas och hur de evolverar. En ny gen kan uppkomma i ett genom på tre olika sätt (Fig. 1)
Dissekera evolutionen
Experimentella metoder för att avslöja drivkrafter och mekanismer
Vi undersöker evolutionens underliggande drivkrafter och med hjälp av experimentell evolution, helgenomsekvensering och genetiska tekniker i bakteriella modellsystem.
Ett projekt fokuserar på faktorer som påverkar evolutionen av nya gener, särskilt vilka faktorer som avgör om en gen som evolverar en ny funktion kommer att behålla sin ursprungliga funktion (bli bifunktionell) eller duplicera och divergera till funktionellt distinkta gener.
Ett annat projekt undersöker co-evolutionen av translationsmaskineriet och kodonanvändningen, och pekar på avvägningen mellan hastighet och noggrannhet vid proteinsyntes som en stark drivkraft i processen. Vi studerar också hur horisontell genöverföring påverkar evolutionen av nya funktioner.
Gruppmedlemmar
Publikationer
Collateral toxicity limits the evolution of bacterial Release Factor 2 towards total omnipotence
Ingår i Molecular biology and evolution, s. 2918-2930, 2020
- DOI för Collateral toxicity limits the evolution of bacterial Release Factor 2 towards total omnipotence
- Ladda ner fulltext (pdf) av Collateral toxicity limits the evolution of bacterial Release Factor 2 towards total omnipotence
Ingår i Frontiers in Microbiology, 2020
- DOI för Mutational Pathways and Trade-Offs Between HisA and TrpF Functions: Implications for Evolution via Gene Duplication and Divergence
- Ladda ner fulltext (pdf) av Mutational Pathways and Trade-Offs Between HisA and TrpF Functions: Implications for Evolution via Gene Duplication and Divergence
Ingår i Frontiers in Microbiology, 2020
- DOI för Synonymous mutations in rpsT lead to ribosomal assembly defects that can be compensated by mutations in fis and rpoA
- Ladda ner fulltext (pdf) av Synonymous mutations in rpsT lead to ribosomal assembly defects that can be compensated by mutations in fis and rpoA
Selection for novel metabolic capabilities in Salmonella enterica
Ingår i Evolution, s. 990-1000, 2019
- DOI för Selection for novel metabolic capabilities in Salmonella enterica
- Ladda ner fulltext (pdf) av Selection for novel metabolic capabilities in Salmonella enterica
Ingår i Molecular biology and evolution, s. 704-718, 2018
- DOI för Experimental Determination and Prediction of the Fitness Effects of Random Point Mutations in the Biosynthetic Enzyme HisA
- Ladda ner fulltext (pdf) av Experimental Determination and Prediction of the Fitness Effects of Random Point Mutations in the Biosynthetic Enzyme HisA
- Fler publikationer