Diarmaid Hughes forskargrupp

Vår nuvarande forskning undersöker hur bakterier kan genomgå radikal evolution genom förvärv av DNA från andra bakterier, inklusive från olika arter, och hur bakterier kan svara på selektion genom att omarrangera organisationen av sitt befintliga genetiska material. Dessutom arbetar vi aktivt med upptäckt och karakterisering av nya antibiotikaföreningar.

Bakteriegenetik, antibiotikaresistans och "fitness"

Våra huvudsakliga forskningsområden är följande:

a) Studera omarrangemang inom bakteriella kromosomer som stimuleras av selektion för överlevnad i suboptimala miljöer – testa och utforska SNAP-hypotesen.

b) Studera selektion, bildning och frekvens av "hybrida" bakteriestammar som bär stora segment av DNA från andra stammar eller arter - ett potentiellt ursprung för globala bakteriepatogener.

c) Vi fungerar som den mikrobiologiska plattformen för ENABLE-2, och spelar en viktig roll i upptäckten, valideringen och utvecklingen av nya antibiotika för akademiska grupper i hela Sverige och resten av Europa.

Diarmaid Hughes Google Scholar

Gruppmedlemmar

Forskningsledare: Diarmaid Hughes

Gruppmedlemmar: Solène Beauvois, Talia Berruga Fernández, Karolina Borowiec, Sha Cao, Sofia Henriksson, Douglas Huseby, Otto Lindahl

Publikationer

Integrated conjugative elements drive the formation of pandemic clones of Escherichia coli with hybrid chromosomes

Berruga Fernández, Talia; Huseby, Douglas L.; Koshla, Oksana; Shaukat, Anum et al.

Ingår i Molecular biology and evolution, 2026
- DOI för Integrated conjugative elements drive the formation of pandemic clones of Escherichia coli with hybrid chromosomes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Integrated conjugative elements drive the formation of pandemic clones of Escherichia coli with hybrid chromosomes
The COMBINE pneumonia model: a multicenter study to standardize a mouse pneumonia model with Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae for antibiotic development

Hansen, Jon U.; Arrazuria, Rakel; Hoover, Jennifer L.; Kerscher, Bernhard et al.

Ingår i Microbiology Spectrum, 2026
- DOI för The COMBINE pneumonia model: a multicenter study to standardize a mouse pneumonia model with Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae for antibiotic development
- Ladda ner fulltext (pdf) av The COMBINE pneumonia model: a multicenter study to standardize a mouse pneumonia model with Pseudomonas aeruginosa and Klebsiella pneumoniae for antibiotic development
Impact of early-life human microbiota on the murine host metabolome: insights from a two-generation HMA mouse model and implications for allergic disease

de Jong, Ymke A.; Seren, Rana M.; Ramsak Marceta, Vida; Checa, Antonio et al.

Ingår i BMC Microbiology, 2025
- DOI för Impact of early-life human microbiota on the murine host metabolome: insights from a two-generation HMA mouse model and implications for allergic disease
- Ladda ner fulltext (pdf) av Impact of early-life human microbiota on the murine host metabolome: insights from a two-generation HMA mouse model and implications for allergic disease
Model-informed drug development for antimicrobials: translational pharmacokinetic-pharmacodynamic modelling of apramycin to facilitate prediction of efficacious dose in complicated urinary tract infections

Hernández-Lozano, Irene; Aranzana-Climent, Vincent; Cao, Sha; Matias, Carina et al.

Ingår i Journal of Antimicrobial Chemotherapy, s. 301-310, 2025
- DOI för Model-informed drug development for antimicrobials: translational pharmacokinetic-pharmacodynamic modelling of apramycin to facilitate prediction of efficacious dose in complicated urinary tract infections
- Ladda ner fulltext (pdf) av Model-informed drug development for antimicrobials: translational pharmacokinetic-pharmacodynamic modelling of apramycin to facilitate prediction of efficacious dose in complicated urinary tract infections
Antibiotic class with potent in vivo activity targeting lipopolysaccharide synthesis in Gram-negative bacteria

Huseby, Douglas L.; Cao, Sha; Zamaratski, Edouard; Sooriyaarachchi, Sanjeewani et al.

Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2024
- DOI för Antibiotic class with potent in vivo activity targeting lipopolysaccharide synthesis in Gram-negative bacteria
- Ladda ner fulltext (pdf) av Antibiotic class with potent in vivo activity targeting lipopolysaccharide synthesis in Gram-negative bacteria
Fler publikationer