Evolutionära mönster
Kursplan, Avancerad nivå, 1BG306
- Kod
- 1BG306
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Biologi A1F
- Betygsskala
- Med beröm godkänd (5), Icke utan beröm godkänd (4), Godkänd (3), Underkänd (U)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 6 november 2007
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
120 hp, inklusive alt. 1) 60 hp biologi samt 30 hp kemi eller 30 hp geovetenskap. alt. 2) 90 hp biologi dessutom kursen Evolutionära mönster 12 hp. I båda fallen dessutom Ekologi MN1 och Evolutionär genetik MN1.
Mål
Kursen fokuserar på hur de evolutionära processerna och den evolutionära historien manifesteras i form av olika mönster som kan observeras i och bland organismer, hur dessa mönster kan detekteras och analyseras för att dra slutsatser om deras orsaker.
Efter kursen ska studenten kunna
- förklara principerna kring, och tillämpa metoder för, detektion och rekonstruktion av evolutionära mönster;
- diskutera, problematisera och relatera evolutionära mönster på olika hierarkiska nivåer till evolutionära processer:
- tillämpa hypoteser om evolutionära mönster för att förklara, diskutera och analysera evolutionära orsakssamband:
- diskutera och kommunicera principer, problem och forskningsresultat i frågor som rör evolutionära mönster samt förklara och använda sig av evolutionsbiologiska begrepp;
- skissera och tillämpa valda (kombinationer av) evolutionsbiologiska tekniker och metoder.
Innehåll
Kursen omfattar studier av evolutionära mönster manifesterade på olika hierarkiska nivåer. Kursen omfattar följande moment
- De biologiska hierarkierna och den evolutionära scenen o Evolutionära enheter, centrala koncept; variation och uppdykande egenskaper, mutation, rekombination; homologi, homoplasi, komplexa system.
- Utvecklingsbiologiska mönster o Genotyp, fenotyp och anpassning på molekylär nivå; ontogeni och morfogenes, genomisk prägling, modularitet, homeobox gener; utvecklingsmässiga begränsningar
- Anagenetiska mönster o Populationer och metapopulationer, funktionsgenomik; kvantitativa egenskaper, form och homologi; kopplingsojämnvikter, allelfrekvenser, koalescens. o Metodik: mikrosatelliter, SNP, QTL kartläggning, morfometri
- Fylogenetiska mönster o Arter och artbegrepp, taxa -ontologi och epistemologi; fylogenier och fylogenetisk analys, substitutionsmodeller, biologisk mångfald, komparativa metoder. o Metodik: DNA sekvensering, fylogenianalys
- Introgressiva mönster o Haploida, diploida och polyploida genom, genominnehåll, genomorganisation; horisontell genöverföring, genduplikationer, hybridisering; metagenomik. o Metodik: mikromatriser och jämförande genomhybridisering.
- Spatiella och temporala mönster o Biogeografi, värd-parasit associationer; fossil och paleontologiska modeller, stratigrafi, diversifiering och utdöenden, datering av fylogenier
Dessutom ingår ett projektarbete i anslutning till forskningsprogrammen på EBC. En seminarieserie vilken brett belyser evolutionsbiologi och evolutionsbiologiska metoder och applikationer löper under kursens gång.
Delkurser: Teori 7 hp; Laborationer 4 hp; Projekt 4 hp
Undervisning
Undervisningen ges i form av föreläsningar, laborationer, seminarier, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten. Deltagande i laborationer, datorövningar, litteraturuppgifter och projektarbeten är obligatoriskt.
Examination
Teoridelen omfattar ett skriftligt prov motsvarande 7 hp och en seminarieserie som har obligatorisk närvaro och följs upp i diskussionsform. Laborationerna motsvarande 4 hp har obligatorisk närvaro och redovisas muntligen eller skriftligen. Projektarbetet redovisas muntligt och i en skriftlig rapport motsvarande 4 hp.
Litteraturlista
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2023
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2022
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2019
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2014
- Litteraturlista giltig från och med vårterminen 2013
- Litteraturlista giltig från och med höstterminen 2007