Mikrobiella reglermekanismer
Kursplan, Avancerad nivå, 1MB431
- Kod
- 1MB431
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Molekylär bioteknik A1F, Teknik A1F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (3), icke utan beröm godkänd (4), med beröm godkänd (5)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 16 mars 2010
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
120 hp inklusive Grundläggande kemi, Organisk kemi, Cellbiologi, Genombiologi, , Mikrobiologi. Makromolekylära maskiner rekommenderas.
Mål
Kursen fokuserar på de regulatoriska mekanismer som mikrober - främst bakterier -använder
sig av för att möta förändringar i fysiologi eller miljö.
Efter godkänd kurs skall studenten kunna
- beskriva de speciella livsbetingelser som gäller för bakterier
- redovisa generellt och i mekanistisk detalj hur mikrobers anpassningar till förändrad intern och extern miljö åstadkoms genom adaptiva responser
- förklara i detalj hur regleringsmekanismer fungerar på transkriptions- och post-tranbskriptionell nivå
- redovisa för kopplingen mellan omvärldssignalering, molekylära genregleringsvägar och fysiologiska responser på cell- eller populationsnivå
- beskriva de extrakromosomala elementens betydelse för genspridning och förvärvande av nya egenskaper
- redovisa för plasmiders speciella egenskaper med avseende på stabil nedärvning och replikationskontroll
- redovisa den växande betydelsen av RNA-medierad kontroll av genuttryck och dess verkningsmekanismer
- sammanfatta, diskutera, värdera och kritiskt analysera deras innehåll och slutsatser i primärartiklar
- kritiskt analysera, tolka och värdera, samt sammanställa erhållna experimentella resultat
Innehåll
Bakteriella genregleringsmekanismer som ligger till grund för adaptiva responser. Översikt och fördjupning i den speciella värld som bakterier lever i. Fokus på svältsituationer, bakteriell stress, differentieringsprocesser samt virulens. Krav som den interna och externa miljön ställer på ändrad fenotyp. Sambandet mellan de signaler som mottas av bakterier samt den genreglering som krävs för att möta fysiologiska krav och iscensätta responser. Genregleringsnivåer: transkriptionell reglering (DNA-nivå) med hjälp av aktivator- och repressorproteiner, post-transkriptionell reglering på mRNAnivå, i synnerhet genom regulatoriska RNA och RNA-element in cis (riborelä). Differentiering av bakterier - sporbildning. Bakteriell kommunikation - kvorumreglering. Genöverföring mellan bakterier, den horisontella genpoolen, plasmider och andra extrakromosomala element. RNA-baserad förvärvad immunitet mot invaderande DNA i bakterier och arkéer (CRISPR/cas). Laborationer ankyter till aktuell forskning i fältet.
Undervisning
Undervisningen ges i form av föreläsningar, seminarier, laborationer och studiebesök. Deltagande i seminarier, laborationer och därtill hörande lektionsundervisning är obligatorisk.
Examination
Skriftligt prov 3 hp, seminarier 1 hp, laborationer 1 hp.