Tillämpad bioinformatik
Kursplan, Avancerad nivå, 1MB519
- Kod
- 1MB519
- Utbildningsnivå
- Avancerad nivå
- Huvudområde(n) med fördjupning
- Bioinformatik A1F, Teknik A1F
- Betygsskala
- Underkänd (U), godkänd (G)
- Fastställd av
- Teknisk-naturvetenskapliga fakultetsnämnden, 26 oktober 2020
- Ansvarig institution
- Institutionen för biologisk grundutbildning
Behörighetskrav
120 hp samt 30 hp från kurserna Proteomik och metabolomik, Skriptprogrammering eller Programmering i Python, Statistisk slutledning för bioinformatik, Kunskapsbaserade system inom bioinformatik, Molekylär evolution, Informationshanteringssystem, Big Data i biovetenskap, Genomanalys, Automatiserad prediktiv modellering.
Mål
Syftet med kursen är att tillämpa tidigare förvärvade kunskaper i ett bioinformatiskt projekt.
Efter godkänd kurs ska studenten kunna:
- planera och genomföra ett bioinformatiskt projekt som syftar till att lösa ett biologiskt, biomedicinskt eller tekniskt problem
- kritiskt analysera, värdera och sammanställa erhållna resultat och presentera dessa i skriftlig och muntlig form för olika målgrupper
- göra välmotiverade vetenskapliga, samhälleliga och etiska bedömningar av projektets alla delar
- söka, värdera och använda vetenskaplig litteratur i ämnen som ligger inom ramen för kursen och implementera denna kunskap i projektet.
Innehåll
Studierna genomförs i form av projektarbeten. Projekten utformas i samråd med uppdragsgivare inom industrin eller akademin och omfattar utveckling av nya verktyg eller tillämpningar av redan befintliga verktyg för att lösa biologiska och biomedicinska problem. Projekten kan t.ex. innefatta genomannotering, genexpressionsanalys, populationsgenetiska analyser eller modellering av metabola reaktionsvägar. Det ingår även träning i att kritiskt analysera och redogöra för styrkor och svagheter i sina egna och andras muntliga och skriftliga presentationer samt i projektarbetet (ingenjörsmässighet, vetenskapligt förhållningssätt och experimentell förmåga).
Undervisning
Projektarbete och seminarier.
Examination
Seminarier (3 hp). Skriftlig och muntlig redovisning av projektarbete (12 hp).
Om särskilda skäl finns får examinator göra undantag från det angivna examinationssättet och medge att en enskild student examineras på annat sätt. Särskilda skäl kan t.ex. vara besked om särskilt pedagogiskt stöd från universitetets samordnare för studenter med funktionsnedsättning.