Fredrik Swartling – Mekanismer bakom hjärntumörer hos barn
I vår forskning studerar vi hur hjärncancer hos barn utvecklas och om vi kan hitta nya behandlingar mot dessa tumörer. Med avancerade modellsystem och singelcellsanalys studerar vi genetiska förändringar och proteiner som regleras på fel sätt i hjärntumörer. Vi försöker även förstå varför vissa tumörer återfaller och hur det kan behandlas.
MYC-proteiner som MYC och MYCN är ofta överproducerade i den maligna hjärntumören medulloblastom som drabbar barn, medan andra tillväxtfaktorer som PDGF ofta finns i ökad mängd i olika typer av elakartade gliom.
Vi använder olika modeller för att efterlikna de tumörer som orsakas av dessa proteiner och studerar tumörceller som odlas i så kallade stamcellskulturer eller som 3D-kulturer, så kallade organoider. Vi vill identifiera vilka celler i hjärnan som kan utgöra ursprungsceller för hjärntumörer och jämför därför dessa celltyper med prover och celler från hjärntumörpatienter. Vi härmar hur olika regioner i hjärnan utvecklas i organoider, t.ex. hjärnstam, lillhjärna och storhjärna. Dessutom studerar vi faktorer som är viktiga för återfall i cancer, t.ex. proteinet SOX9 som är viktigt för cancercellens motståndskraft mot standardbehandling.
Bromsa tumören och förhindra återfall
Vi har under olika stadier av tumörutvecklingen upptäckt att MYC- och PDGF-proteiner samverkar med andra proteiner som vi nu hoppas vi kan använda som mål för att försöka bromsa hjärntumörens framfart och även hindra återfall av tumörerna. Vi använder förutom avancerad sekvensering på singelcellsnivå även avancerad bioinformatisk analys och målinriktad terapi för att förstå hur behandlingsresistens uppstår vid återfall.
Vi hoppas att våra upptäckter kan ge en ökad förståelse för hur man ska kunna behandla dessa allvarliga cancerformer.

Normal struktur hos lillhjärna (till vänster) jämfört med den oorgansierade strukturen vid medulloblastom (till höger).
Gruppmedlemmar
Publikationer
-
A tumor-associated photoreceptor signature unifies distinct central nervous system malignancies
Ingår i Cancer Cell, s. 831-845, 2026
- DOI för A tumor-associated photoreceptor signature unifies distinct central nervous system malignancies
- Ladda ner fulltext (pdf) av A tumor-associated photoreceptor signature unifies distinct central nervous system malignancies
-
Ingår i Biochemical Pharmacology, 2026
- DOI för Albacarcin V adds EPLIN as a novel and promising target for the treatment of female cancers and pediatric medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Albacarcin V adds EPLIN as a novel and promising target for the treatment of female cancers and pediatric medulloblastoma
-
Childhood brain tumors instruct cranial hematopoiesis and immunotolerance
Ingår i Nature Genetics, s. 317-328, 2026
- DOI för Childhood brain tumors instruct cranial hematopoiesis and immunotolerance
- Ladda ner fulltext (pdf) av Childhood brain tumors instruct cranial hematopoiesis and immunotolerance
-
Ingår i Nature Genetics, s. 143-156, 2026
- DOI för Investigation of a global mouse methylome atlas reveals subtype-specific copy number alterations in pediatric cancer models
- Ladda ner fulltext (pdf) av Investigation of a global mouse methylome atlas reveals subtype-specific copy number alterations in pediatric cancer models
-
Development of an orthotopic medulloblastoma zebrafish model for rapid drug testing
Ingår i Neuro-Oncology, s. 779-794, 2025
- DOI för Development of an orthotopic medulloblastoma zebrafish model for rapid drug testing
- Ladda ner fulltext (pdf) av Development of an orthotopic medulloblastoma zebrafish model for rapid drug testing
-
Ingår i Cell Death and Disease, 2025
- DOI för Identification of a small molecule targeting EPLIN as a novel strategy for the treatment of pediatric neuroblastoma and medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Identification of a small molecule targeting EPLIN as a novel strategy for the treatment of pediatric neuroblastoma and medulloblastoma
-
Rolling Ultrasharp Microneedle Spheres Enable Topical Delivery of Biologics Through the Skin
Ingår i Advanced Healthcare Materials, 2025
- DOI för Rolling Ultrasharp Microneedle Spheres Enable Topical Delivery of Biologics Through the Skin
- Ladda ner fulltext (pdf) av Rolling Ultrasharp Microneedle Spheres Enable Topical Delivery of Biologics Through the Skin
-
Ingår i Nature Communications, 2025
- DOI för scFFPE-ATAC enables high-throughput single cell chromatin accessibility profiling in formalin-fixed paraffin-embedded samples
- Ladda ner fulltext (pdf) av scFFPE-ATAC enables high-throughput single cell chromatin accessibility profiling in formalin-fixed paraffin-embedded samples
-
The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
Ingår i Cell Death and Differentiation, s. 1915-1929, 2025
- DOI för The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av The transcription factor LHX2 mediates and enhances oncogenic BMP signaling in medulloblastoma
-
Drivers Underlying Metastasis and Relapse in Medulloblastoma and Targeting Strategies
Ingår i Cancers, 2024
- DOI för Drivers Underlying Metastasis and Relapse in Medulloblastoma and Targeting Strategies
- Ladda ner fulltext (pdf) av Drivers Underlying Metastasis and Relapse in Medulloblastoma and Targeting Strategies
-
An Indolin-3-imine Photobase and pH Sensitive Fluorophore
Ingår i ChemPhotoChem, 2023
- DOI för An Indolin-3-imine Photobase and pH Sensitive Fluorophore
- Ladda ner fulltext (pdf) av An Indolin-3-imine Photobase and pH Sensitive Fluorophore
-
Ingår i Nature Communications, 2023
- DOI för ARF suppression by MYC but not MYCN confers increased malignancy of aggressive pediatric brain tumors
- Ladda ner fulltext (pdf) av ARF suppression by MYC but not MYCN confers increased malignancy of aggressive pediatric brain tumors
-
Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
Ingår i Cell Death and Disease, 2023
- DOI för Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
-
Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
Ingår i Neuro-Oncology, s. 97-107, 2023
- DOI för Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
- Ladda ner fulltext (pdf) av Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
-
Photoinduced ring‐opening and phototoxicity of an indolin‐3‐one derivative
Ingår i Chemistry - A European Journal, 2023
- DOI för Photoinduced ring‐opening and phototoxicity of an indolin‐3‐one derivative
- Ladda ner fulltext (pdf) av Photoinduced ring‐opening and phototoxicity of an indolin‐3‐one derivative
-
Ingår i Cell Reports, 2022
- DOI för Article Basal cell carcinomas acquire secondary mutations to overcome dormancy and progress from microscopic to macroscopic disease
- Ladda ner fulltext (pdf) av Article Basal cell carcinomas acquire secondary mutations to overcome dormancy and progress from microscopic to macroscopic disease
-
Dormant SOX9-Positive Cells Facilitate MYC-Driven Recurrence of Medulloblastoma
Ingår i Cancer Research, s. 4586-4603, 2022
- DOI för Dormant SOX9-Positive Cells Facilitate MYC-Driven Recurrence of Medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Dormant SOX9-Positive Cells Facilitate MYC-Driven Recurrence of Medulloblastoma
-
Ingår i Cancers, 2022
- DOI för Iron Chelator VLX600 Inhibits Mitochondrial Respiration and Promotes Sensitization of Neuroblastoma Cells in Nutrition-Restricted Conditions
- Ladda ner fulltext (pdf) av Iron Chelator VLX600 Inhibits Mitochondrial Respiration and Promotes Sensitization of Neuroblastoma Cells in Nutrition-Restricted Conditions
-
Ingår i RSC Advances, s. 14544-14550, 2022
- DOI för Photophysical characterization and fluorescence cell imaging applications of 4-N-substituted benzothiadiazoles
- Ladda ner fulltext (pdf) av Photophysical characterization and fluorescence cell imaging applications of 4-N-substituted benzothiadiazoles
-
Profiling chromatin accessibility in formalin-fixed paraffin-embedded samples
Ingår i Genome Research, s. 150-161, 2022
- DOI för Profiling chromatin accessibility in formalin-fixed paraffin-embedded samples
- Ladda ner fulltext (pdf) av Profiling chromatin accessibility in formalin-fixed paraffin-embedded samples
-
Ingår i Journal for ImmunoTherapy of Cancer, 2021
- DOI för Deep immune profiling reveals targetable mechanisms of immune evasion in immune checkpoint inhibitor-refractory glioblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Deep immune profiling reveals targetable mechanisms of immune evasion in immune checkpoint inhibitor-refractory glioblastoma
-
Ingår i Nucleic Acids Research, 2021
- DOI för FACT-seq: profiling histone modifications in formalin-fixed paraffin-embedded samples with low cell numbers
- Ladda ner fulltext (pdf) av FACT-seq: profiling histone modifications in formalin-fixed paraffin-embedded samples with low cell numbers
-
Ingår i RSC Advances, s. 23960-23967, 2021
- DOI för Indolylbenzothiadiazoles as highly tunable fluorophores for imaging lipid droplet accumulation in astrocytes and glioblastoma cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av Indolylbenzothiadiazoles as highly tunable fluorophores for imaging lipid droplet accumulation in astrocytes and glioblastoma cells
-
Ingår i Molecular Cancer Research, s. 1831-1839, 2021
-
Targeting MYCN in Molecularly Defined Malignant Brain Tumors
Ingår i Frontiers in Oncology, 2021
- DOI för Targeting MYCN in Molecularly Defined Malignant Brain Tumors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Targeting MYCN in Molecularly Defined Malignant Brain Tumors
-
Ingår i Cancer Research, s. 2101-2115, 2021
-
A Patient-Derived Cell Atlas Informs Precision Targeting of Glioblastoma
Ingår i Cell Reports, 2020
- DOI för A Patient-Derived Cell Atlas Informs Precision Targeting of Glioblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av A Patient-Derived Cell Atlas Informs Precision Targeting of Glioblastoma
-
Medulloblastomics revisited: biological and clinical insights from thousands of patients
Ingår i Nature Reviews. Cancer, s. 42-56, 2020
-
Modeling SHH-driven medulloblastoma with patient iPS cell-derived neural stem cells
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 20127-20138, 2020
- DOI för Modeling SHH-driven medulloblastoma with patient iPS cell-derived neural stem cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av Modeling SHH-driven medulloblastoma with patient iPS cell-derived neural stem cells
-
Ingår i Cancers, 2020
- DOI för Nuclear Receptor Binding Protein 2 Is Downregulated in Medulloblastoma, and Reduces Tumor Cell Survival upon Overexpression
- Ladda ner fulltext (pdf) av Nuclear Receptor Binding Protein 2 Is Downregulated in Medulloblastoma, and Reduces Tumor Cell Survival upon Overexpression
-
Perturbation-based gene regulatory network inference to unravel oncogenic mechanisms
Ingår i Scientific Reports, 2020
- DOI för Perturbation-based gene regulatory network inference to unravel oncogenic mechanisms
- Ladda ner fulltext (pdf) av Perturbation-based gene regulatory network inference to unravel oncogenic mechanisms
-
Ingår i Bioinformatics, s. 3357-3364, 2019
- DOI för Batch-normalization of cerebellar and medulloblastoma gene expression datasets utilizing empirically defined negative control genes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Batch-normalization of cerebellar and medulloblastoma gene expression datasets utilizing empirically defined negative control genes
-
BET and Aurora Kinase A inhibitors synergize against MYCN-positive human glioblastoma cells
Ingår i Cell Death and Disease, 2019
- DOI för BET and Aurora Kinase A inhibitors synergize against MYCN-positive human glioblastoma cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av BET and Aurora Kinase A inhibitors synergize against MYCN-positive human glioblastoma cells
-
Ingår i Cell Stem Cell, s. 433-+, 2019
- DOI för Engineering Genetic Predisposition in Human Neuroepithelial Stem Cells Recapitulates Medulloblastoma Tumorigenesis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Engineering Genetic Predisposition in Human Neuroepithelial Stem Cells Recapitulates Medulloblastoma Tumorigenesis
-
Ingår i Cell Stem Cell, s. 855-870, 2019
- DOI för Humanized Stem Cell Models of Pediatric Medulloblastoma Reveal an Oct4/mTOR Axis that Promotes Malignancy
- Ladda ner fulltext (pdf) av Humanized Stem Cell Models of Pediatric Medulloblastoma Reveal an Oct4/mTOR Axis that Promotes Malignancy
-
Ingår i Journal of Pathology, s. 228-240, 2019
-
Combined BET bromodomain and CDK2 inhibition in MYC-driven medulloblastoma
Ingår i Oncogene, s. 2850-2862, 2018
- DOI för Combined BET bromodomain and CDK2 inhibition in MYC-driven medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Combined BET bromodomain and CDK2 inhibition in MYC-driven medulloblastoma
-
GMYC: A Novel Inducible Transgenic Model of Group 3 Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 137-137, 2018
-
Ingår i Brain, s. 1300-1319, 2018
-
Microglia Induce PDGFRB Expression in Glioma Cells to Enhance Their Migratory Capacity
Ingår i iScience, s. 71-83, 2018
- DOI för Microglia Induce PDGFRB Expression in Glioma Cells to Enhance Their Migratory Capacity
- Ladda ner fulltext (pdf) av Microglia Induce PDGFRB Expression in Glioma Cells to Enhance Their Migratory Capacity
-
Notch1 regulates the initiation of metastasis and self-renewal of Group 3 medulloblastoma
Ingår i Nature Communications, 2018
- DOI för Notch1 regulates the initiation of metastasis and self-renewal of Group 3 medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Notch1 regulates the initiation of metastasis and self-renewal of Group 3 medulloblastoma
-
Ingår i Neuro-Oncology, s. 139-139, 2018
-
Loss of Conservation of Graph Centralities in Reverse-engineered Transcriptional Regulatory Networks
Ingår i Methodology and Computing in Applied Probability, s. 1089-1105, 2017
- DOI för Loss of Conservation of Graph Centralities in Reverse-engineered Transcriptional Regulatory Networks
- Ladda ner fulltext (pdf) av Loss of Conservation of Graph Centralities in Reverse-engineered Transcriptional Regulatory Networks
-
Ingår i Frontiers in Oncology, 2017
- DOI för Mast Cell Infiltration in Human Brain Metastases Modulates the Microenvironment and Contributes to the Metastatic Potential
- Ladda ner fulltext (pdf) av Mast Cell Infiltration in Human Brain Metastases Modulates the Microenvironment and Contributes to the Metastatic Potential
-
Medulloblastoma: experimental models and reality
Ingår i Acta Neuropathologica, s. 679-689, 2017
-
Modeling and Targeting MYC Genes in Childhood Brain Tumors
Ingår i Genes, 2017
- DOI för Modeling and Targeting MYC Genes in Childhood Brain Tumors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Modeling and Targeting MYC Genes in Childhood Brain Tumors
-
Ingår i Cancer Research, s. 802-812, 2017
-
Ingår i Oncotarget, s. 24815-24827, 2017
- DOI för Serglycin as a potential biomarker for glioma: association of serglycin expression, extent of mast cell recruitment and glioblastoma progression
- Ladda ner fulltext (pdf) av Serglycin as a potential biomarker for glioma: association of serglycin expression, extent of mast cell recruitment and glioblastoma progression
-
Targeting SOX9 for degradation to inhibit chemoresistance, metastatic spread, and recurrence
Ingår i Molecular & Cellular Oncology, 2017
-
FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma
Ingår i EMBO Journal, s. 2192-2212, 2016
- DOI för FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma
-
Ingår i PLOS Genetics, 2016
- DOI för Utilizing the Dog Genome in the Search for Novel Candidate Genes Involved in Glioma Development-Genome Wide Association Mapping followed by Targeted Massive Parallel Sequencing Identifies a Strongly Associated Locus
- Ladda ner fulltext (pdf) av Utilizing the Dog Genome in the Search for Novel Candidate Genes Involved in Glioma Development-Genome Wide Association Mapping followed by Targeted Massive Parallel Sequencing Identifies a Strongly Associated Locus
-
Ingår i Cancer Cell, s. 72-84, 2015
- DOI för Combined MYC and P53 Defects Emerge at Medulloblastoma Relapse and Define Rapidly Progressive, Therapeutically Targetable Disease
- Ladda ner fulltext (pdf) av Combined MYC and P53 Defects Emerge at Medulloblastoma Relapse and Define Rapidly Progressive, Therapeutically Targetable Disease
-
Deregulated proliferation and differentiation in brain tumors
Ingår i Cell and Tissue Research, s. 225-254, 2015
-
BET Bromodomain Inhibition of MYC-Amplified Medulloblastoma
Ingår i Clinical Cancer Research, s. 912-925, 2014
-
Glial origin for MYCN-driven medulloblastoma and targeted prosenescence therapies
Ingår i Cancer Research, 2014
-
Ingår i Neuro-Oncology, s. 90-90, 2014
-
Metastasis and tumor recurrence from rare SOX9-positive cells in Group 4 medulloblastoma
Ingår i Cancer Research, 2014
-
Metastasis and Tumor Recurrence from Rare SOX9-Positive Cells in MYCN-Driven Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, 2014
-
Ingår i Cancer Research, 2014
-
Oncoprotein stabilization in brain tumors
Ingår i Oncogene, s. 4709-4721, 2014
-
Signals that regulate the oncogenic fate of neural stem cells and progenitors
Ingår i Experimental Neurology, s. 56-68, 2014
-
A glial origin for medulloblastoma and inhibition of MYCN stabilization
Ingår i Cancer Research, 2013
-
Humanized Mouse Models for Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 30-30, 2013
-
Targeting the Translational Apparatus in Mycn-Driven Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 16-16, 2013
-
What underlies the diversity of brain tumors?
Ingår i Cancer Metastasis Review, s. 5-24, 2013
-
Distinct Neural Stem Cell Populations Give Rise to Disparate Brain Tumors in Response to N-MYC
Ingår i Cancer Cell, s. 601-613, 2012
-
miRNA-21 is developmentally regulated in mouse brain and is co-expressed with SOX2 in glioma
Ingår i BMC Cancer, s. 378, 2012
- DOI för miRNA-21 is developmentally regulated in mouse brain and is co-expressed with SOX2 in glioma
- Ladda ner fulltext (pdf) av miRNA-21 is developmentally regulated in mouse brain and is co-expressed with SOX2 in glioma
-
Myc proteins in brain tumor development and maintenance
Ingår i Upsala Journal of Medical Sciences, s. 122-131, 2012
-
Pleiotropic role for MYCN in medulloblastoma
Ingår i Genes & Development, s. 1059-1072, 2010
-
Ingår i Oncogene, s. 3121-3131, 2009
-
Identifying Candidate Genes Involved in Brain Tumor Formation
Ingår i Upsala Journal of Medical Sciences, s. 1-38, 2008
-
Ingår i Oncogene, s. 3896-3905, 2005
-
Identification of candidate cancer-causing genes in mouse brain tumors by retroviral tagging
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 11334-11337, 2004