Fredrik Swartling – Mekanismer bakom hjärntumörer hos barn
I vår forskning studerar vi hur hjärncancer hos barn utvecklas och om vi kan hitta nya behandlingar mot dessa tumörer. Med avancerade modellsystem och singelcellsanalys studerar vi genetiska förändringar och proteiner som regleras på fel sätt i hjärntumörer. Vi försöker även förstå varför vissa tumörer återfaller och hur det kan behandlas.
MYC-proteiner som MYC och MYCN är ofta överproducerade i den maligna hjärntumören medulloblastom som drabbar barn, medan andra tillväxtfaktorer som PDGF ofta finns i ökad mängd i olika typer av elakartade gliom.
Vi använder olika modeller för att efterlikna de tumörer som orsakas av dessa proteiner och studerar tumörceller som odlas i så kallade stamcellskulturer eller som 3D-kulturer, så kallade organoider. Vi vill identifiera vilka celler i hjärnan som kan utgöra ursprungsceller för hjärntumörer och jämför därför dessa celltyper med prover och celler från hjärntumörpatienter. Här studerar vi faktorer som t.ex. proteinet SOX9 som är viktigt för både stamcellsbiologi och cancercellens motståndskraft mot standardbehandling.
Bromsa tumören och förhindra återfall
Vi har under olika stadier av tumörutvecklingen upptäckt att MYC- och PDGF-proteiner samverkar med andra proteiner som vi nu hoppas vi kan använda som mål för att försöka bromsa hjärntumörens framfart och även hindra återfall av tumörerna. Vi använder förutom avancerad sekvensering på singelcellsnivå även avancerad bioinformatisk analys och målinriktad terapi för att förstå hur behandlingsresistens uppstår vid återfall.
Vi hoppas att våra upptäckter kan ge en ökad förståelse för hur man ska kunna behandla dessa allvarliga cancerformer.
![Mikroskopibilder som visar på en tydlig struktur hos normal lillhjärna jämfört med en oorgansierad struktur vid medulloblastom](/images/200.3c0702271918da7bd49145e/1724679732422/Medulloblastom%20Swartling.jpg)
Normal struktur hos lillhjärna (till vänster) jämfört med den oorgansierade strukturen vid medulloblastom (till höger).
Gruppmedlemmar
Publikationer
Drivers Underlying Metastasis and Relapse in Medulloblastoma and Targeting Strategies
Ingår i Cancers, 2024
- DOI för Drivers Underlying Metastasis and Relapse in Medulloblastoma and Targeting Strategies
- Ladda ner fulltext (pdf) av Drivers Underlying Metastasis and Relapse in Medulloblastoma and Targeting Strategies
An Indolin-3-imine Photobase and pH Sensitive Fluorophore
Ingår i ChemPhotoChem, 2023
- DOI för An Indolin-3-imine Photobase and pH Sensitive Fluorophore
- Ladda ner fulltext (pdf) av An Indolin-3-imine Photobase and pH Sensitive Fluorophore
Ingår i Nature Communications, 2023
- DOI för ARF suppression by MYC but not MYCN confers increased malignancy of aggressive pediatric brain tumors
- Ladda ner fulltext (pdf) av ARF suppression by MYC but not MYCN confers increased malignancy of aggressive pediatric brain tumors
Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
Ingår i Cell Death and Disease, 2023
- DOI för Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av Identification of ATF3 as a novel protective signature of quiescent colorectal tumor cells
Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
Ingår i Neuro-Oncology, s. 97-107, 2023
- DOI för Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
- Ladda ner fulltext (pdf) av Novel cancer gene discovery using a forward genetic screen in RCAS-PDGFB-driven gliomas
Photoinduced ring‐opening and phototoxicity of an indolin‐3‐one derivative
Ingår i Chemistry - A European Journal, 2023
- DOI för Photoinduced ring‐opening and phototoxicity of an indolin‐3‐one derivative
- Ladda ner fulltext (pdf) av Photoinduced ring‐opening and phototoxicity of an indolin‐3‐one derivative
Ingår i Cell Reports, 2022
- DOI för Article Basal cell carcinomas acquire secondary mutations to overcome dormancy and progress from microscopic to macroscopic disease
- Ladda ner fulltext (pdf) av Article Basal cell carcinomas acquire secondary mutations to overcome dormancy and progress from microscopic to macroscopic disease
Dormant SOX9-Positive Cells Facilitate MYC-Driven Recurrence of Medulloblastoma
Ingår i Cancer Research, s. 4586-4603, 2022
- DOI för Dormant SOX9-Positive Cells Facilitate MYC-Driven Recurrence of Medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Dormant SOX9-Positive Cells Facilitate MYC-Driven Recurrence of Medulloblastoma
Ingår i Cancers, 2022
- DOI för Iron Chelator VLX600 Inhibits Mitochondrial Respiration and Promotes Sensitization of Neuroblastoma Cells in Nutrition-Restricted Conditions
- Ladda ner fulltext (pdf) av Iron Chelator VLX600 Inhibits Mitochondrial Respiration and Promotes Sensitization of Neuroblastoma Cells in Nutrition-Restricted Conditions
Ingår i RSC Advances, s. 14544-14550, 2022
- DOI för Photophysical characterization and fluorescence cell imaging applications of 4-N-substituted benzothiadiazoles
- Ladda ner fulltext (pdf) av Photophysical characterization and fluorescence cell imaging applications of 4-N-substituted benzothiadiazoles
Profiling chromatin accessibility in formalin-fixed paraffin-embedded samples
Ingår i Genome Research, s. 150-161, 2022
- DOI för Profiling chromatin accessibility in formalin-fixed paraffin-embedded samples
- Ladda ner fulltext (pdf) av Profiling chromatin accessibility in formalin-fixed paraffin-embedded samples
Ingår i Journal for ImmunoTherapy of Cancer, 2021
- DOI för Deep immune profiling reveals targetable mechanisms of immune evasion in immune checkpoint inhibitor-refractory glioblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Deep immune profiling reveals targetable mechanisms of immune evasion in immune checkpoint inhibitor-refractory glioblastoma
Ingår i Nucleic Acids Research, 2021
- DOI för FACT-seq: profiling histone modifications in formalin-fixed paraffin-embedded samples with low cell numbers
- Ladda ner fulltext (pdf) av FACT-seq: profiling histone modifications in formalin-fixed paraffin-embedded samples with low cell numbers
Ingår i RSC Advances, s. 23960-23967, 2021
- DOI för Indolylbenzothiadiazoles as highly tunable fluorophores for imaging lipid droplet accumulation in astrocytes and glioblastoma cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av Indolylbenzothiadiazoles as highly tunable fluorophores for imaging lipid droplet accumulation in astrocytes and glioblastoma cells
Ingår i Molecular Cancer Research, s. 1831-1839, 2021
Targeting MYCN in Molecularly Defined Malignant Brain Tumors
Ingår i Frontiers in Oncology, 2021
- DOI för Targeting MYCN in Molecularly Defined Malignant Brain Tumors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Targeting MYCN in Molecularly Defined Malignant Brain Tumors
Ingår i Cancer Research, s. 2101-2115, 2021
A Patient-Derived Cell Atlas Informs Precision Targeting of Glioblastoma
Ingår i Cell Reports, 2020
- DOI för A Patient-Derived Cell Atlas Informs Precision Targeting of Glioblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av A Patient-Derived Cell Atlas Informs Precision Targeting of Glioblastoma
Medulloblastomics revisited: biological and clinical insights from thousands of patients
Ingår i Nature Reviews. Cancer, s. 42-56, 2020
Modeling SHH-driven medulloblastoma with patient iPS cell-derived neural stem cells
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 20127-20138, 2020
- DOI för Modeling SHH-driven medulloblastoma with patient iPS cell-derived neural stem cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av Modeling SHH-driven medulloblastoma with patient iPS cell-derived neural stem cells
Ingår i Cancers, 2020
- DOI för Nuclear Receptor Binding Protein 2 Is Downregulated in Medulloblastoma, and Reduces Tumor Cell Survival upon Overexpression
- Ladda ner fulltext (pdf) av Nuclear Receptor Binding Protein 2 Is Downregulated in Medulloblastoma, and Reduces Tumor Cell Survival upon Overexpression
Perturbation-based gene regulatory network inference to unravel oncogenic mechanisms
Ingår i Scientific Reports, 2020
- DOI för Perturbation-based gene regulatory network inference to unravel oncogenic mechanisms
- Ladda ner fulltext (pdf) av Perturbation-based gene regulatory network inference to unravel oncogenic mechanisms
Ingår i Bioinformatics, s. 3357-3364, 2019
- DOI för Batch-normalization of cerebellar and medulloblastoma gene expression datasets utilizing empirically defined negative control genes
- Ladda ner fulltext (pdf) av Batch-normalization of cerebellar and medulloblastoma gene expression datasets utilizing empirically defined negative control genes
BET and Aurora Kinase A inhibitors synergize against MYCN-positive human glioblastoma cells
Ingår i Cell Death and Disease, 2019
- DOI för BET and Aurora Kinase A inhibitors synergize against MYCN-positive human glioblastoma cells
- Ladda ner fulltext (pdf) av BET and Aurora Kinase A inhibitors synergize against MYCN-positive human glioblastoma cells
Ingår i Cell Stem Cell, s. 433-+, 2019
- DOI för Engineering Genetic Predisposition in Human Neuroepithelial Stem Cells Recapitulates Medulloblastoma Tumorigenesis
- Ladda ner fulltext (pdf) av Engineering Genetic Predisposition in Human Neuroepithelial Stem Cells Recapitulates Medulloblastoma Tumorigenesis
Ingår i Cell Stem Cell, s. 855-870, 2019
- DOI för Humanized Stem Cell Models of Pediatric Medulloblastoma Reveal an Oct4/mTOR Axis that Promotes Malignancy
- Ladda ner fulltext (pdf) av Humanized Stem Cell Models of Pediatric Medulloblastoma Reveal an Oct4/mTOR Axis that Promotes Malignancy
Ingår i Journal of Pathology, s. 228-240, 2019
Combined BET bromodomain and CDK2 inhibition in MYC-driven medulloblastoma
Ingår i Oncogene, s. 2850-2862, 2018
- DOI för Combined BET bromodomain and CDK2 inhibition in MYC-driven medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Combined BET bromodomain and CDK2 inhibition in MYC-driven medulloblastoma
GMYC: A Novel Inducible Transgenic Model of Group 3 Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 137-137, 2018
Ingår i Brain, s. 1300-1319, 2018
Microglia Induce PDGFRB Expression in Glioma Cells to Enhance Their Migratory Capacity
Ingår i iScience, s. 71-83, 2018
- DOI för Microglia Induce PDGFRB Expression in Glioma Cells to Enhance Their Migratory Capacity
- Ladda ner fulltext (pdf) av Microglia Induce PDGFRB Expression in Glioma Cells to Enhance Their Migratory Capacity
Notch1 regulates the initiation of metastasis and self-renewal of Group 3 medulloblastoma
Ingår i Nature Communications, 2018
- DOI för Notch1 regulates the initiation of metastasis and self-renewal of Group 3 medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av Notch1 regulates the initiation of metastasis and self-renewal of Group 3 medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 139-139, 2018
Loss of Conservation of Graph Centralities in Reverse-engineered Transcriptional Regulatory Networks
Ingår i Methodology and Computing in Applied Probability, s. 1089-1105, 2017
- DOI för Loss of Conservation of Graph Centralities in Reverse-engineered Transcriptional Regulatory Networks
- Ladda ner fulltext (pdf) av Loss of Conservation of Graph Centralities in Reverse-engineered Transcriptional Regulatory Networks
Ingår i Frontiers in Oncology, 2017
- DOI för Mast Cell Infiltration in Human Brain Metastases Modulates the Microenvironment and Contributes to the Metastatic Potential
- Ladda ner fulltext (pdf) av Mast Cell Infiltration in Human Brain Metastases Modulates the Microenvironment and Contributes to the Metastatic Potential
Medulloblastoma: experimental models and reality
Ingår i Acta Neuropathologica, s. 679-689, 2017
Modeling and Targeting MYC Genes in Childhood Brain Tumors
Ingår i Genes, 2017
- DOI för Modeling and Targeting MYC Genes in Childhood Brain Tumors
- Ladda ner fulltext (pdf) av Modeling and Targeting MYC Genes in Childhood Brain Tumors
Ingår i Cancer Research, s. 802-812, 2017
Ingår i Oncotarget, s. 24815-24827, 2017
- DOI för Serglycin as a potential biomarker for glioma: association of serglycin expression, extent of mast cell recruitment and glioblastoma progression
- Ladda ner fulltext (pdf) av Serglycin as a potential biomarker for glioma: association of serglycin expression, extent of mast cell recruitment and glioblastoma progression
Targeting SOX9 for degradation to inhibit chemoresistance, metastatic spread, and recurrence
Ingår i Molecular & Cellular Oncology, 2017
FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma
Ingår i EMBO Journal, s. 2192-2212, 2016
- DOI för FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma
- Ladda ner fulltext (pdf) av FBW7 suppression leads to SOX9 stabilization and increased malignancy in medulloblastoma
Ingår i PLOS Genetics, 2016
- DOI för Utilizing the Dog Genome in the Search for Novel Candidate Genes Involved in Glioma Development-Genome Wide Association Mapping followed by Targeted Massive Parallel Sequencing Identifies a Strongly Associated Locus
- Ladda ner fulltext (pdf) av Utilizing the Dog Genome in the Search for Novel Candidate Genes Involved in Glioma Development-Genome Wide Association Mapping followed by Targeted Massive Parallel Sequencing Identifies a Strongly Associated Locus
Ingår i Cancer Cell, s. 72-84, 2015
- DOI för Combined MYC and P53 Defects Emerge at Medulloblastoma Relapse and Define Rapidly Progressive, Therapeutically Targetable Disease
- Ladda ner fulltext (pdf) av Combined MYC and P53 Defects Emerge at Medulloblastoma Relapse and Define Rapidly Progressive, Therapeutically Targetable Disease
Deregulated proliferation and differentiation in brain tumors
Ingår i Cell and Tissue Research, s. 225-254, 2015
BET Bromodomain Inhibition of MYC-Amplified Medulloblastoma
Ingår i Clinical Cancer Research, s. 912-925, 2014
Glial origin for MYCN-driven medulloblastoma and targeted prosenescence therapies
Ingår i Cancer Research, 2014
Ingår i Neuro-Oncology, s. 90-90, 2014
Metastasis and tumor recurrence from rare SOX9-positive cells in Group 4 medulloblastoma
Ingår i Cancer Research, 2014
Metastasis and Tumor Recurrence from Rare SOX9-Positive Cells in MYCN-Driven Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, 2014
Ingår i Cancer Research, 2014
Oncoprotein stabilization in brain tumors
Ingår i Oncogene, s. 4709-4721, 2014
Signals that regulate the oncogenic fate of neural stem cells and progenitors
Ingår i Experimental Neurology, s. 56-68, 2014
A glial origin for medulloblastoma and inhibition of MYCN stabilization
Ingår i Cancer Research, 2013
Humanized Mouse Models for Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 30-30, 2013
Targeting the Translational Apparatus in Mycn-Driven Medulloblastoma
Ingår i Neuro-Oncology, s. 16-16, 2013
What underlies the diversity of brain tumors?
Ingår i Cancer Metastasis Review, s. 5-24, 2013
Distinct Neural Stem Cell Populations Give Rise to Disparate Brain Tumors in Response to N-MYC
Ingår i Cancer Cell, s. 601-613, 2012
miRNA-21 is developmentally regulated in mouse brain and is co-expressed with SOX2 in glioma
Ingår i BMC Cancer, s. 378, 2012
- DOI för miRNA-21 is developmentally regulated in mouse brain and is co-expressed with SOX2 in glioma
- Ladda ner fulltext (pdf) av miRNA-21 is developmentally regulated in mouse brain and is co-expressed with SOX2 in glioma
Myc proteins in brain tumor development and maintenance
Ingår i Upsala Journal of Medical Sciences, s. 122-131, 2012
Pleiotropic role for MYCN in medulloblastoma
Ingår i Genes & Development, s. 1059-1072, 2010
Ingår i Oncogene, s. 3121-3131, 2009
Identifying Candidate Genes Involved in Brain Tumor Formation
Ingår i Upsala Journal of Medical Sciences, s. 1-38, 2008
Ingår i Oncogene, s. 3896-3905, 2005
Identification of candidate cancer-causing genes in mouse brain tumors by retroviral tagging
Ingår i Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, s. 11334-11337, 2004
Dormant SOX9-positive cells behind MYC-driven medulloblastoma recurrence