Farmaceutisk bioinformatik

Om kursen

Kursen ger grundläggande kunskaper om hur bioinformatiska verktyg kan användas vid biologisk forskning inom farmakologi, farmaci och läkemedelskemi, relaterat till läkemedel och läkemedelsutveckling. Fokus ligger på förståelse och användande av programvaror snarare än de underliggande matematiska teorierna. Kursen innehåller introduktion och historik till farmaceutisk bioinformatik, biologiska och kemiska databaser, teori och metoder för analys av experimentella data, design av experiment, beräkning av läkemedelskandidaters egenskaper, proteokemometri, dockning, och virtuell läkemedelsscreening.

Efter avslutad kurs ska du kunna:

• beskriva hur bioinformatiska verktyg kan användas inom läkemedelsforskning
• använda bio- och kemoinformatiska programvaror, till exempel för sekvenslinjering (sequence alignment), 3D-visualisering och struktur-aktivitetsbaserade metoder såsom proteokemometri
• utföra experimentell design baserat på biovetenskapliga data
• söka relevant information i biologiska och kemiska databaser
• beräkna potentiella läkemedels egenskaper (deskriptorer) och korrelera dessa till målproteinsinteraktioner genom bioinformatisk modellering
• tolka och validera resultat från ovannämnda metoder.

Uppläggning för distanskurs: Kursen är internetbaserad och har inga obligatoriska träffar. Undervisningen består av handledda individuella studier via en webbaserad undervisningsmiljö som också används för gruppövningar, diskussioner och inlämningsuppgifter. Kommunikation mellan studenter och lärare sker via kursens webbplats och via e-post. För att delta i undervisningen krävs dator med internetuppkoppling. Skriftlig examination via webbplatsen.